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一、检测原理
全基因合成miR潜在结合位点上下游~500bp(LncRNA、circRNA或mRNA的3’UTR)野生形式WT及结合位点的突变形式Mut,克隆到psiCHECK-2多克隆位点处(1640-1674)(图1),然后与miR的mimics/NC共同转染293T细胞测定荧光素酶读值即可。
二、载体构建与Mimics合成
1、构建WT miR潜在结合位点到psiCHECK-2载体,命名为WT;
2、构建Mut miR潜在结合位点到psiCHECK-2载体,命名为Mut(突变模式:A/T与G/C互变);
3、合成待测miR的Mimmics及阴性对照NC。
三、 实验分组信息
|
|
psiCHECK- Target 序列 |
miR |
Target-1 |
1 |
WT |
NC |
2 |
WT |
Mimics |
|
3 |
Mut |
NC |
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4 |
Mut |
Mimics |
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Target-2 |
1 |
WT |
NC |
2 |
WT |
Mimics |
|
3 |
Mut |
NC |
|
4 |
Mut |
Mimics |
四、具体实验步骤:
(一) 细胞转染操作步骤
1、事先准备好用于转染的分到96孔板中的293T 细胞和目的质粒,待细胞密度达到50%-70%为宜。
2、将10 ml DMEM与0.16 mg的lncRNA (circRNA/3’UTR)/Mut目的质粒以及5 pmol的miR/Negative.Control(N.C)Mimics充分混匀后室温放置(溶液A);然后将10 ml DMEM与0.3 ml 的转染试剂(转染试剂为汉恒生物产品LipoFiter,浓度为0.8 mg/ml)充分混匀(溶液B),室温放置5 min。
3、将溶液A与溶液B充分混匀,室温放置20 min。
4、转染前为细胞换取新鲜培养基,之后将转染混合物加入混匀。37℃,5% CO2培养。
5、转染6 h后换取新鲜培养基,转染48 h后收集细胞检测。
(二) 检测实验操作步骤
检测试剂盒:Promega Dual-Luciferase system
1、将5´PLB (Passive Lysis Buffer)用蒸馏水稀释至1´PLB,以96孔板每孔100 ml的量加入,用移液枪吹打打散细胞,置于室温摇床上缓慢摇15分钟后,将细胞裂解液吸至1.5 ml离心管,4度12000 rpm (13200g)离心10 min,取上清移入新的管子;
2、96孔板中加入Luciferase Assay Reagent II (LAR II)( Luciferase Assay Reagent, Progema)工作液100 ml;
3、加入20 ml细胞裂解液,移液枪吹打混匀2-3次,测定记录Firefly luciferase值,此值为内参值。
4、加入100 ml Stop & Glo® Reagent(Luciferase Assay Reagent, Progema),移液枪吹打混匀2-3次,测定记录Renilla luciferase值,此即为报告基因发光值。
五、 预期实验结果
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